NextCODE——药明康德出海淘来的一块金

火石创造特约记者:王舒浩 2016-11-09 09:50 新媒体 来源:思达派 查看原文

图片1.png随着基因测序价格越来越低,越来越多的基因数据将积累起来,基因技术对健康的影响,将变成计算和分析的能力问题。基因测序技术的革新、生物医学分析技术的进步以及大数据分析工具的出现,正成为推动精准医疗的核心力量。药明康德将与NextCODE一起成为测序革命的领军企业,推动全球医学不断进步!


火石特约记者:王舒浩


公司.png

公司名片

公司名称:WuXi NextCODE Genomics

创立时间:2015

公司属地:总部中国上海

所属行业:医疗健康

公司网址:www.wuxinextcode.com

公司创始人:Hannes Smarason

主要产品:RareCODE 、HealthCODE、FamilyCODE

核心技术:NextCODE基因平台


公司简介


NextCODE Health是业界领先的基因分析和生物信息公司,致力于帮助全球临床医生、科研机构和企业研发人员充分利用全基因组学更好地诊断和治疗疾病。


NextCODE Health公司的前身是来自冰岛的DeCODE公司,该公司首先发现了多种疾病相关的遗传基因。2010年该公司启动了世界上最大的测序项目,检测了超过三十万人的全基因组序列,构建了全球唯一储存超过三十万人全基因组信息的数据库。2012年被安进公司收购。


2013年10月,NextCODE从安进公司获得由DeCODE开发的基因临床诊断应用技术的五年独家授权。


2015年1月药明康德以6500万美元收购NextCODE Health公司,并与药明康德基因中心合并,成立了WuXi NextCODE Genomics公司,新公司将为全球客户提供全面基因测序及生物信息服务,包括CLIA认证的全基因组、全外显子组测序服务,以及为诊断和治疗提供必要的测序数据分析,阐释等服务。


公司创始人兼首席运营官


图片1.png


Hannes  Smarason先生是公司联合创始人兼首席运营官,他与Jeff Gulcher博士一起创立了WuXi NextCODE,他曾担任DeCODE公司、风险投资公司Polaris和ARCH的长期顾问,帮助完成了Amgen公司4.15亿美元对DeCODE的收购。在加入DeCODE公司之前,他是McKinsey公司的顾问。


产品.png


商业模式画布


图片2.png


核心资源


NextCODE通过自主研发,开发出一套通用的、专为大规模基因组数据优化的数据架构GOR(Genomic Ordered Relational,基因组有序关系)和分析软件GORpipe,用于管理和挖掘全基因组序列数据,并构建出数据库系统GORdb。该研究成果发表于生物信息专业领域国际顶级期刊《Bioinformatics》。


其中GOR的高效率使得NextCODE能够为基因组学提供全球第一个有效的DNA互联网。这意味着无论客户在哪里都可以使用自己和合作伙伴的患者数据进行协作,分析驻留在不同大洲服务器上的临床数据并访问全部参考数据。


封面.jpg


分析软件GORpipe,基于DeCODE在冰岛开展的大规模人群研究成果、多年的基因组学分析经验和知识累积,系统每个内置命令都是专门为基因组学数据设计。平常需要大量编程实现的功能,在GORpipe系统中仅需简单的一行查询命令即可实现,大大简化和加速了生物信息的分析流程,而且整套GORpipe工具对非商业用途完全免费。


图片3.png

NextCODE基于以上研究,建立了独特的基因大数据平台,提供从序列数据存储、高级分析到基因组注释一系列流程的快速服务,易用的页面可以无缝接入用户所有数据(包括全球参考数据),识别关键变量,解决用户面临的问题。


分析平台目前主要应用在以下四个领域:


临床诊断:NextCODE在临床诊断中使用的是一款在线二代测序数据分析工具——临床序列分析工具CSA,它能提供易用的界面,帮助用户快速分析数据。系统基于GOR(Genomic Ordered Relational)架构,可处理千兆字节规模的数据,提供大规模并行自查询和分析能力。


临床应用:序列挖掘功能使客户能够使用自己的脚本和工具,根据需要识别关联变量链接到患者的表型。


癌症突变基因检测:NextCODE肿瘤突变分析功能使临床医生能够比较肿瘤和正常全基因组数据,以识别个别突变肿瘤基因。


深度学习:NextCODE也在生命科学领域开拓人工智能的应用,专有的DeepCODE算法使用DNA、RNA和蛋白质数据来映射和识别信号,可以自动分类疾病和识别新型基因组变体。


NextCODE基因分析平台的优势


图片4.png

图片来源:http://www.lagou.com/gongsi/103790.html


关键业务


基于独有的平台,NextCODE针对中国市场开发出了分析产品RareCODE、HealthCODE和FamilyCODE。


RareCODE


中国约有5500万儿童患有未确诊的罕见疾病。公司正与两家最大的儿科医院——复旦和瑞金进行合作,希望解决这一迫切的医疗需求。通过应用公司罕见病诊断分析,希望能改善患者治疗和前景。WuXi NextCODE与华为发布的中国精密医学云平台将加速这一进程,它能使专家获得来自其他地区患者的序列,创建中国人群的疾病变异数据库。


HealthCODE


HealthCODE开创了中国的全基因组健康扫描业务,它利用公司在美国和欧洲采用的黄金标准技术,使中国人也可以更好地了解和保护自身的健康。


它由WuXi NextCODE的合作医疗机构在临床中提供,检测稀有疾病变体和常见的疾病风险因素,为如何保持健康提供具体建议。


FamilyCODE


中国每年有2400万人怀孕,所以中国夫妇对了解他们是否携带可遗传的罕见或严重疾病基因有很大需求。FamilyCODE可以筛选检测中国人群中已知的大约200种疾病的危险因素。


合作伙伴


2015年4月WuXi NextCODE Genomics与DNA数据管理分析在线工具提供商DNAnexus结成战略联盟,双方联合推出全球首个一体化精准医学平台,以加速推进基因组学在全球范围的广泛应用。药明康德投资1500万美元,将WuXi NextCODE基因分析技术与DNAnexus云平台相结合,与药明康德中国及全球研发平台无缝对接。


通过此次战略合作,WuXi NextCODE独有的基因组学数据库模型、临床和研究接口可以直接在DNAnexus云端使用,用户可以在同一个平台上存储、阐释他们的测序数据,并且与全球同行开展合作。两家公司将在中国提供同样的平台,使用户可以在药明康德的开放式技术平台上互通使用他们的基因组数据。


2015年9月WuXi NextCODE Genomics同上海复旦大学儿童医院合作进行全基因组和外显子组测序来诊断儿童罕见病。


2015年11月WuXi NextCODE Genomics与基因信息解读公司N-of-One签署全球合作协议,双方将展开深度合作,确认引发癌症的驱动突变,为患者提供更加个性化的治疗方案。


图片5.png

市场和竞争对手分析


随着基因测序成本的下降,拥有数据量的多少已经不再是唯一关键的竞争优势。是否能将海量的大数据进行解读,转换成具体能够应用的有效信息,才是测序企业发展的核心竞争力。


目前国外很多公司都建立了自己的大型数据库并开发相关的软件进行快速数据分析。Myriad genetics公司拥有专有数据库来进行大数据的一体化分析,可用来解释不确定的遗传检测结果。Myriad genetics进行基因数据分析解读已有30多年,受到医学界的广泛认可。


Tute Genomics公司以云技术为依托,结合全世界的基因组学信息,为基于基因组学的精密医疗提供相应数据与决策。致力于解码患者基因信息,并在此基础上提供个体化医疗方案。


但WuXi NextCODE独有的数据库模型、临床和肿瘤对照分析报告系统,使临床医生可以对病患基因测序数据进行有效分析。2015年,WuXi NextCODE的分析系统成为Genomics England选用的唯一一家应用在所有分析类别的数据分析系统,为英国国家基因组计划提供罕见病及癌症病人的全基因组测序临床数据解析服务。


火视观点.png


NextCODE公司将全基因组分析系统与全球最大规模的临床基因对照数据库进行结合,使得全球临床医生和研究人员能够通过任何网络浏览器,在单个碱基分辨率的基础上实时存储、查看并分析基因数据。


药明康德基因中心是国内第一家也是唯一一家,通过美国CLIA认证的二代测序实验室,实现了国内全基因组测序最高标准:独家承诺Q30 PF data>80%。


药明康德基因中心的基因测序与NextCODE的信息分析专长相结合,WuXi NextCODE有潜力成为全球基因组医学领域的领军企业,为全球客户提供全方位的临床、科研和诊断测试产品及服务,并推动新一代基因测序在疾病诊治及个性化医疗方面更加全面和深入的应用。


信息来源:http://seq.cn/portal.php?mod=view&aid=17370


更多资讯欢迎关注火石官方微信:火石创造(firestone-link)

为您推荐: